Từ đầu năm 2017 đến hết tháng 3/2019, cơ quan Hải quan đã chủ trì, phối hợp phát hiện, bắt giữ 87 vụ việc vi phạm pháp luật về thực thi Công ước CITES (Công ước về buôn bán quốc tế các loại động vật, thực vật hoang dã nguy cấp), trong đó đã phát hiện nhiều vụ vi phạm quy mô lớn.
Điển hình vụ phát hiện, bắt giữ hơn 1,8 tấn ngà voi và hơn 6,3 tấn vảy tê tê ngày 5/10/2018 tại cảng Tiên Sa- Đà Nẵng; 2 vụ liên tiếp ngày 25/1 và 30/1/2019 tại khu vực cảng Hải Phòng, bắt giữ tổng cộng 2,8 tấn vảy tê tê và hơn 600 kg ngà voi.
Công tác đấu tranh phòng, chống buôn bán, vận chuyển trái phép động vật hoang dã đã được Bộ Tài chính chỉ đạo Tổng cục Hải quan tăng cường triển khai quyết liệt các khâu nghiệp vụ, từ khâu nắm tình hình, thu thập thông tin, phân tích, cảnh báo rủi ro, khoanh vùng, xác định trọng điểm, phát hiện vi phạm đến đấu tranh chuyên án, bắt giữ, xứ lý vi phạm nhằm kiểm soát chặt chẽ các hoạt động này.
Để chủ động phát hiện, ngăn chặn sớm các dấu hiệu vi phạm, ngoài công tác nắm tính hình, thu thấp thông tin theo phương thức truyền thống, cơ quan Hải quan còn đẩy mạnh hoạt động trực chỉ huy trực tuyến 24/7 để theo dõi, phân tích thông tin dựa trên các cơ sở dữ liệu của Ngành, cơ sở dữ liệu một cửa quốc gia và các cơ sở dữ liệu khác, đồng thời giám sát trực tuyến các hoạt động xuất nhập khẩu tại các cửa khẩu, cảng hàng không, cảng biển, kịp thời hỗ trợ các đơn vị hải quan địa phương phát hiện những dấu hiệu bất thường, phương thức, thủ đoạn của đối tượng trọng điểm để có các biện pháp theo dõi, mật phục, kiểm tra, xử lý.
Bên cạnh đó, thời gian qua, Tổng cục Hải quan đã phối hợp chặt chẽ với Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn triển khai hiệu quả Cơ chế một cửa quốc gia. Trong đó thủ tục cấp Giấy phép CITES và một số thủ tục về cấp giấy chứng nhận kiểm dịch động vật, sản phẩm động vật, thực vật xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh.
Việc triển khai các thủ tục này trên Cổng thông tin một cửa quốc gia có ý nghĩa rất lớn trong việc liên kết, liên thông giữa các cơ quan quản lý với cơ quan Hải quan trong việc quản lý hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh thuộc diện phảm quản lý chuyên ngành, góp phần tạo thuận lợi, giảm thời gian, chi phí cho các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực này.
Công tác phối hợp hoạt động trong nước, lực lượng Hải quan các cấp phối hợp chặt chẽ với các lực lượng chức năng trong công tác chia sẻ thông tin, tuần tra, kiểm soát, đấu tranh phát hiện, xử lý các đường dây, ổ nhóm buôn bán trái phép động, thực vật hoang dã.
Từ đầu năm 2018 đến nay, lực lượng Hải quan đã chủ trì phối hợp với các lực lượng chức năng phát hiện, bắt giữ, xử lý 17 vụ vi phạm liên quan đến động thực vật hoang dã. Trong đó, nhiều vụ buôn lậu có quy mô lớn, điển hình gần nhất là vụ chủ trì, phối hợp với Cục Cảnh sát môi trường (Bộ Công an), Phòng Cảnh sát phòng chống tội phạm về môi trường, Phòng Cảnh sát điều tra tội phạm về tham nhũng, buôn lậu (Công an TPĐà Nẵng), Đồn Biên phòng cửa khẩu cảng Đà Nẵng phát hiện, bắt giữ hơn 9 tấn ngà voi tại cảng Tiên Sa-Đà Nẵng ngày 27/3/2019.
Bộ Tài chính đã chỉ đạo Tổng cục Hải quan chủ động thúc đẩy các hoạt động hợp tác song phương và đa phương với lực lượng hải quan, lực lượng Interpol trong khu vực và trên thế giới. Qua đó đã xây dựng và hình thành được cơ chế hợp tác, đầu mối trao đổi, chia sẽ thông tin tình báo hải quan với nhiều quốc gia.