Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam dự kiến sẽ được xây dựng trên diện tích khoảng 10ha tại xã Mễ Trì, huyện Từ Liêm, Hà Nội.
Tiến sĩ Phạm Văn Lực, Giám đốc Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam thuộc Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam cho biết, 3 ha sẽ được giành cho các gian trưng bày trong nhà gồm 5 khu: Vũ trụ, trái đất và sự sống; thiên nhiên và con người Việt Nam; tài nguyên thiên nhiên Việt Nam; bảo vệ tài nguyên và thiên nhiên Việt Nam; sự phát triển của khoa học kỹ thuật. Phần còn lại là khu trưng bày ngoài trời.
Hiện Bảo tàng thiên nhiên Việt Nam đang gấp rút lấy ý kiến của các nhà khoa học nhằm phác họa kịch bản trưng bày ngoài trời về các giá tị thiên nhiên của Việt Nam.
Theo Qui hoạch tổng thể hệ thống bảo tàng thiên nhiên Việt Nam đến năm 2020, Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam gồm nhà bảo tàng, vườn thực vật, vườn động vật, bộ sưu tập mẫu vật quốc gia, các khu trưng bày ngoài trời sẽ được xây dựng trên địa bàn Hà Nội, Vĩnh Phúc và Hà Tây từ nay đến năm 2010.